莲峰庙横连三座，内殿二进，供奉着多位神抵。门前广场宽旷，围以石栏，建筑宏伟，庙貌森严。庙门有幅楹联“莲花涵镜海；峰景接连瀛”。首进为天后殿，供奉天后圣母，天后殿左右为关帝殿、药王殿。二进为观音殿，供奉观音大师。观音殿后依次为吕祖殿、金花娘娘殿。庙后为小花园，有亭台花草，风景宜人。
天后殿前有一亭台，是清朝官吏到澳门巡阅、审案的场所。清道光十九年（１８３９年），两广总督林则徐为了禁烟而亲到澳门巡视，临时驻在该庙，并在莲峰庙台案传见过澳葡官员。现在庙前树立着林则徐的石像，并建立了林则徐纪念馆，天后殿挂有“恩光浩大”的牌匾，以纪念他在澳门重振国威的辉煌历史。
